注冊環保工程師執業資格基礎考試采取閉卷考試的方式，時間1 天，上、下午各4小時。共計120題，試題結構均為四選一的單選題。

注冊環保工程師執業資格專業考試采取開卷考試的方式，時間2天，每天上、下午各3小時，第一天為專業知識考試，上、下午各70題，前40題為單選題，后30題為多選題。專業知識考試不分專業方向，均為必答題;第二天為專業案例考試，每個專業方向上、下午各25題，考生可根據自己的實際情況，上、下午只能選擇同一專業方向的25題作答，多選或跨專業方向選答無效。第二天專業案例考試要求考生在答題卡選擇正確答案的同時，應在試卷上寫出解答的詳細過程。