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甲硝唑用于治療腸道和腸外阿米巴病(如阿米巴肝膿腫、胸膜阿米巴病等)。還可用于治療陰道滴蟲病、小袋蟲病和皮膚利什曼病、麥地那龍線蟲感染等。目前還廣泛用于厭氧菌感染的治療。

抗阿米巴及抗滴蟲藥，用于各種阿米巴病及滴蟲病，也用于各種厭氧菌所致的敗血癥、心內膜炎、下呼吸道感染、腹腔內感染、婦科、中樞神經系統、骨、關節和皮膚軟組織感染等。某些污染或可能污染的手術，如選擇性結腸直腸手術，本品可作為術后感染的預防用藥。

本品適用于陰道滴蟲病、各種類型的阿米巴病。治療賈第蟲病的療效可達100%。本品還用于治療厭氧菌感染，對熱帶性嗜酸粒細胞增多癥、偽膜性腸炎、克隆病、麥地那龍線蟲感染等也有良效。此外，本品尚可用于治療微絲蚴感染、小袋蟲病和皮膚利什曼病。

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